CI telah dikritik kerana pautan kepada syarikat seperti BP, Cargill, Chevron, Monsanto dan Shell.[24][25] CI mempertahankan kerjanya dengan sektor swasta, dengan alasan bahawa perubahan memerlukan kerjasama dengan syarikat yang mempunyai kesan alam sekitar yang besar.[26]

Artikel 2008 dalam The Nation mendakwa bahawa organisasi itu telah menarik $6 juta untuk pemuliharaan marin di Papua New Guinea, tetapi dana itu digunakan untuk "sedikit daripada sekadar setakat pejabat mewah dan perjalanan kelas pertama."[27] CI telah menggembar-gemburkan operasinya di Papua New Guinea, mendakwa bahawa mereka telah menyumbang kepada penemuan saintifik baharu dan penubuhan kawasan perlindungan baharu.[28] Setakat 2016, CI tidak lagi berfungsi secara langsung di Papua New Guinea.[29]